Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR1EP28566 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms