Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PLNP26678 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms