Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPREP23469 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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