Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms