Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms