Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms