Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms