Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms