Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF1P10914 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF1P10914 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms