Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3P10147 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms