Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms