Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms