Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAPBO95292 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAPBO95292 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAPBO95292 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPBO95292 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPBO95292 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms