Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYNGR2O43760 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms