Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DENRO43583 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms