Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PLXNB1O43157 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PLXNB1O43157 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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