Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms