Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR11A4FU01 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms