Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPDC1A2A3K4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPDC1A2A3K4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPDC1A2A3K4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPDC1A2A3K4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPDC1A2A3K4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPDC1A2A3K4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms