Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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