Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms