Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11EQ9UL52 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms