Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms