Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARHGAP28Q9P2N2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARHGAP28Q9P2N2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms