Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN3Q9P232 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms