Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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