Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms