Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms