Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB9BQ9NP90 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RAB9BQ9NP90 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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