Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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