Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms