Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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