Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms