Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3CQ99985 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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