Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms