Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms