Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms