Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4DQ92854 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4DQ92854 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms