Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNOT9Q92600 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms