Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms