Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms