Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GDPD1Q8N9F7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms