Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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LINC00299Q6ZSB3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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