Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms