Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms