Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms