Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms