Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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