Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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