Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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